Hlavním cílem bylo zastavení trvalé vlhkosti ve všech sálech nepodsklepených přístaveb historické části. Během rekonstrukce došlo k odstranění nevhodného podlahového souvrství. Byla vyměněna okna, elektroinstalace a samozřejmě i vlastní knihovní mobiliář.

V nově zrekonstruovaných prostorách tak vzniklo důstojné zázemí pro muzejní knihovnu a také pro badatele se zájmem o přírodní vědy, vlastivědu, historii, umění a další obory. Při citlivé rekonstrukci nebylo zasahováno do půdorysu budovy ani do významných dochovaných historických konstrukcí. Během rekonstrukce proběhl v areálu archeologický průzkum, který byl prezentován veřejnosti při slavnostním otevření nově zrekonstruovaných sálů.